《良药苦口》第二季中，波士顿名外科医生 Martin Best 因严重晕血症搬到缅因州海边小镇 Port Wenn 当全科医生。经历首季风波后，他虽逐渐融入社区，却因让助理 Elaine 代为抽血，面临行医执照可能被吊销的危机。新季从五个月后展开：Martin 一边接受纪律处分、努力克服恐惧，一边继续处理小镇居民层出不穷的古怪病症与突发事故。当一名“美人鱼”被冲上岸、药房遭劫而 Louisa 急需的药物失窃时，他必须在混乱中证明自己的专业价值，也重新思考自己与 Louisa、姑妈 Sarah 及这座小镇的关系。