《实习医生风云》第十一季继续讲述J.D.、特克与艾略特回到圣心医院后的生活。昔日实习医生如今成为资深医师，既要救治病人，也要指导性格迥异的新一代住院医生。新季开始，J.D.为照顾考克斯医生向老友求助，艾略特则在多年后重新找回自信。医院安排导师配对，特克指导达莎娜，艾略特带领萨姆，J.D.却难以与新任住院总医师格兰特建立默契。在荒诞幻想、职场摩擦与感情变化之间，众人学习接受年龄增长和角色转变，也重新理解友谊、责任与成为好医生的意义。